FACT safeguards promoter topology by maintaining nucleosomes and restricting chromatin factor spreading
该研究通过高分辨率染色质构象捕获技术证明，FACT 复合物通过维持核小体完整性并限制染色质结合因子的扩散，从而在体内保障活性启动子的纳米结构域拓扑及长程染色质架构。
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molecular biology
376 篇论文
ZNF121 recruits YTHDF2 to modulate mRNA stability
该研究揭示 C2H2 型锌指蛋白 ZNF121 作为 YTHDF2 的辅助因子，通过招募 YTHDF2 至靶标 mRNA 上（独立于 m6A 修饰）促进其降解，从而在细胞周期调控及 DNA 损伤反应中发挥关键作用。
The amyloid packing difference: a pairwise comparison metric for amyloid structures
本文提出了一种名为“淀粉样蛋白堆积差异”（APD）的新指标，用于通过量化交叉β堆积相互作用和侧链取向的差异来比较同一蛋白的不同淀粉样纤维结构，并验证了该指标能有效区分与不同疾病相关的淀粉样蛋白构象。
p63 and p73 regulate convergent and factor-specific transcriptional programs in cutaneous squamous cell carcinoma
该研究揭示了 p63 与 p73 通过形成异源复合物并共占据增强子，在皮肤鳞状细胞癌中协同驱动核心增殖程序，同时分别特异性调控上皮谱系及 DNA 复制/应激通路，并通过共调控 EGFR 配体（尤其是双调蛋白）建立正反馈信号模块以维持肿瘤发生。
PARP6-dependent vimentin ADP-ribosylation prevents myofibroblast activation in cardiac fibrosis
该研究揭示了 PARP6 通过 ADP-核糖基化修饰波形蛋白（vimentin）抑制 RhoA 信号通路及肌动蛋白应力纤维形成，从而阻止心肌成纤维细胞活化并发挥心脏保护作用，其表达缺失会加剧心脏纤维化。
Vector-enabled metagenomics reveals the first detection of the geminivirus beet curly top Iran virus in Europe
该研究利用结合滚环扩增与高通量测序的媒介昆虫宏基因组学技术，首次在欧洲检测到原本仅分布于伊朗和安纳托利亚地区的甜菜曲顶伊朗病毒（BCTIV），并证实西瓜和西葫芦为其天然及实验宿主。
Structural and functional characterisation of the dextran utilisome from Bacteroides thetaiotaomicron
本研究通过 X 射线晶体学、等温滴定量热法和冷冻电镜技术，解析了拟杆菌属*Bacteroides thetaiotaomicron*中负责利用糊精的“糊精利用体”（dextran utilisome）的高分辨率结构及其动态构象变化，揭示了其核心 SusCD 复合物与辅助蛋白（GHdex 和 SBGPdex）协同结合底物的分子机制。
CUTS RNA Biosensor for the Real-Time Detection of TDP-43 Loss-of-Function
该研究开发了一种名为 CUTS 的实时 RNA 生物传感器，能够灵敏、准确地检测 TDP-43 功能丧失（如错误定位或聚集）导致的病理隐外显子积累，并展示了其作为自我调节基因疗法载体在治疗 TDP-43 相关神经退行性疾病中的潜力。
NPM1 mislocalization mediated by RNA Pol I inhibition alters chromatin landscape
该研究表明，RNA 聚合酶 I 抑制通过破坏核仁结构并诱导 NPM1 易位，触发 HDAC1/SUV39H1 介导的组蛋白去乙酰化与甲基化级联反应，进而导致全基因组染色质可及性丧失、DNA 高甲基化以及核内三维结构从核仁相关结构域向异染色质相关结构域的重塑。
A novel RAB5 binding site in human VPS34-CII that is likely the primordial site in eukaryotic evolution
该研究通过高分辨率冷冻电镜结构分析发现，人源 VPS34 复合物 II 中 VPS15 亚基上存在一个可能为进化起源的 RAB5 结合位点，并揭示了该位点与 VPS34 C2 域结合位点的协同作用及其在真核生物进化中从单一结合位点向双结合位点扩展以适应复杂内吞系统的机制。
Prevalence and Molecular Detection of Pasteurella multocida, Mannheimia hemolytica, and Bibersteinia trehalosi in Sheep, Western Oromia, Ethiopia
该研究在埃塞俄比亚西部奥罗米亚地区通过跨断面调查证实，绵羊中巴氏杆菌科细菌（尤其是多杀性巴氏杆菌）的总检出率为 21.1%，且患病状态和年龄是显著的风险因素，凸显了针对肺炎性巴氏杆菌病进行分子鉴定及制定针对性防控措施的必要性。
Cooperative and competitive interactions among transcription regulatory elements modulate transcription output
该研究通过开发 CIERA-seq 技术，揭示了转录调控元件（启动子和增强子）通过招募不同因子在局部转录枢纽中既协同又竞争地相互作用，从而共同调控转录输出。
Accurate quantification of canine mitochondrial DNA copy number and its evaluation as a biomarker of brain injury
该研究首次开发并验证了一种准确检测犬类线粒体 DNA 拷贝数的方法，并通过初步数据表明血液中线粒体 DNA 水平升高可能作为犬急性脑损伤的潜在生物标志物。
Protocol for rapid allelic discrimination qPCR genotyping of the Winnie mouse model
本文介绍了一种利用 TaqMan 等位基因鉴别 qPCR 技术，通过单反应快速、无需后处理地从粗提 DNA 中准确鉴定 Winnie 小鼠 Muc2 基因 p.Cys52Tyr 突变的基因分型方案。
A Multi-Modal AI/ML-based Framework for Protein Conformation Selection and Prediction in Drug Discovery Applications
本文提出了一种基于图卷积网络的多模态人工智能框架，通过整合蛋白质的全局理化特征与局部药效团信息，有效提升了药物发现中蛋白质构象选择及结合状态预测的准确性与鲁棒性。
The role of charge, hydrophobicity, and cooperativity in target search of SOX2 and ESRRB
该研究通过结合单分子成像与基因组分析，揭示了转录因子 SOX2 和 ESRRB 的电荷、疏水性及协同作用如何共同调控其在细胞核内的靶点搜索效率与特异性，并发现 ESRRB 高度依赖与 SOX2 的相互作用来缩短搜索时间并维持基因组结合。
Loop Extrusion Accelerates Long-Range Enhancer-Promoter Searches in Living Embryos
该研究通过活体胚胎成像、遗传操作及聚合物模拟，揭示了由 NIPBL 驱动的定向环挤出机制与 CTCF 锚定元件协同作用，通过“扫描并捕获”模型加速长程增强子 - 启动子搜索，从而精确调控基因表达的时机与水平。
Insulin resistance modifies longitudinal multi-omics responses to habitual diet
这项为期一年的多组学研究揭示，胰岛素敏感性是决定个体对习惯性饮食产生代谢和微生物组响应差异的关键因素，其中胰岛素敏感者表现出更强的饮食关联性，且饮食、代谢物、微生物及免疫标志物共同有助于预测十年期动脉粥样硬化性心血管疾病风险。
A PERK/FOXO1 AXIS LINKS DNA DAMAGE TO FIBROBLAST SURVIVAL IN DIFFUSE CUTANEOUS SYSTEMIC SCLEROSIS
该研究揭示在弥漫性皮肤系统性硬化症中，成纤维细胞通过激活 PERK/ATF4/FOXO1 代谢适应轴来抑制线粒体依赖性凋亡，从而在严重 DNA 损伤下得以存活，而靶向该通路可恢复其凋亡敏感性，为治疗提供了新策略。
CNOT6 deadenylase safeguards postnatal growth and metabolic transition via Fgf21 mRNA decay
该研究揭示了 CNOT6 去腺苷酸化酶通过促进 Fgf21 mRNA 降解来限制其表达，从而在出生后关键期维持合成代谢、保障正常生长发育及代谢转换的分子机制。